《表1 根尖和侧根区差异表达基因显著富集的前30个GO条目》

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《基于RNA-seq的水稻根尖和侧根区愈伤组织诱导中生长素相关基因差异表达分析》

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对根尖和侧根区差异表达的基因分别进行GO功能注释和富集分析，差异表达基因被划分到3种GO类别中:生物学过程（biological process）、细胞组分（cellular component）和分子功能（molecule function）；三个GO分类下又有不同的GO条目。我们根据显著性P<0.05选取了显著富集前30的GO条目，发现根尖和侧根区前30条全部显著富集（表1）。根尖中差异表达基因显著富集的前30个GO条目包括:10个生物学过程GO条目（酰胺的生物学合成、酰胺的代谢等）、14个细胞组分GO条目和6个分子功能GO条目。侧根区差异表达基因显著富集的前30个GO条目包括:14个生物学过程GO条目（氧化还原过程、氧化应激反应等）、5个细胞组分GO条目和11个分子功能GO条目（氧化还原酶活性、过氧化物酶活性、作用于过氧化氢作为受体的氧化还原酶活性、抗氧化活动、作用于配对供体的氧化还原酶活性等）。由此可知，CIM诱导24 h后根尖和侧根区差异表达基因均在氧化还原反应相关的多个GO条目显著富集，暗示高浓度的生长素导致根尖和侧根区细胞内的氧化还原状态发生了显著变化。