《表1 蛋鸡肝脏中可变剪切事件发生的类型与数量》
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《基因可变剪切差异对蛋鸡首次产蛋前后肝脏细胞内吞功能的影响》
在参考基因组上对比分析获得的Reads,结果表明,产蛋前1周3个肝脏组织样品读长(Reads)比对到基因区域的Reads占所有Reads的百分比,即基因组的比对率分别为86.70%、87.05%和87.58%,产蛋后1周3个肝脏样品Reads的对比率分别为89.52%、84.38%和88.84%。这2组数据经卡方检验其P值为0.955 0,表明产蛋前后可变剪切的基因数量总数在基因组水平上没有差异。分析得到可变剪切事件在产蛋前后分别为14 518和14 683个,涉及的基因分别为5 274个和5 337个,可变剪切涉及的基因占基因组全部已知基因的31.62%。平均每个基因有2.75个剪切体转录本。本文分析了鸡肝脏在首次产蛋前后的5种可变剪切方式。由表1可见,外显子跳跃事件最多,产蛋前后分别有11 669个和11 807个,5'可变剪切位点事件最少,产蛋前后分别有325个和336个。这2组数据经卡方检验分析得出产蛋前1周和后1周在可变剪切总量和各种可变剪切的数量上都没有显著差异。在鸡肝脏基因表达组的可变剪切类型中,外显子跳跃是主要剪切方式,占所有可变剪切事件80.4%,是蛋白质形成差异的主要机制。
图表编号 | XD00159869900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.10 |
作者 | 李慧锋、石雄、黄翔、张玳维、刘悦磊、张臻、朱文进、朱芷葳 |
绘制单位 | 山西农业大学生命科学学院、山西农业大学生命科学学院、山西农业大学生命科学学院、山西农业大学生命科学学院、山西农业大学生命科学学院、山西农业大学生命科学学院、河北师范科技学院动物科技学院、山西农业大学生命科学学院 |
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