《表2 代表菌株16S rRNA基因序列比对结果》
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《泓森槐可培养内生固氮细菌多样性与潜在促生长特性评价》
通过IS-PCR指纹图谱聚类结果,每个类群选出一株具有代表性的菌株进行16S rRNA基因的PCR扩增及测序,测序结果用DNAStar软件进行序列拼接与矫正,将所得序列提交至GenBank,登录号分别为H11(MN841793)、H21(MN841790)、H31(MN841788)、H41(MN841789)、H51(MN841797)、H61(MN841796)、H71(MN841795)、H81(MN841792)、H91(MN841791)、H101(MN841794),通过EzBioCloud数据库与NCBI数据库对比得到相似性最高菌株。对比结果如表2所示,类群Ⅰ与类芽孢杆菌属(Paenibacillus sabinae T27T)相似性98.6%,类群Ⅱ与克雷伯氏菌属(Klebsiella michiganensis W14T)相似性100%,类群Ⅲ与卡萨克尼亚氏菌属(Kosakonia radicincitans DSM16656T)相似性99.8%,类群Ⅳ与卡萨克尼亚氏菌属(Kosakonia pseudosacchari JM387T)相似性99.4%,类群Ⅴ与中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium erdmanii USDA3471T)相似性100%,类群Ⅵ与中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium huakuii IAM14158T)相似性99.8%,类群Ⅶ与中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium silamurunense CCBAU01550T)相似性100%,类群Ⅷ与假单胞菌属(Pseudomonas geniculata ATCC19374T)相似性100%。类群Ⅸ与伯克霍尔德菌属(Burkholderia territorii LMG28158T)相似性99.8%。类群Ⅹ与德沃斯氏菌属(Devosia riboflavina IFO13584T)相似性100%。用各类群代表菌株的16S rRNA基因序列与其相似菌株的16S rRNA基因序列构建系统发育树,如图2所示,各类群代表菌株皆与其最相近菌株聚在了一个分支上,展现出了泓森槐植株组织内生固氮细菌的系统发育关系。
图表编号 | XD00156691200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.20 |
作者 | 付思远、席雨晴、赵鹏菲、梁永健、宋旭、常华瑜、彭桂香、谭志远 |
绘制单位 | 华南农业大学农学院、华南农业大学农学院、华南农业大学农学院、华南农业大学农学院、华南农业大学农学院、华南农业大学农学院、华南农业大学资源环境学院、华南农业大学农学院 |
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