《表3 定位群体中部分重组体的育性与连锁分子标记的重组》

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《栽培稻种间杂种不育基因S1的图位克隆》

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注:1:IRAT216S1型；2:IRAT216型；3:杂合型；GFF:配子全可育；GSS:配子半不育

利用筛选得到的10对有效分子标记对IRAT2-16S1-G1、IRAT216S1-G2、IRAT216S1-G3近等基因系进行扫描检测发现，IRAT216S1-G1的替换片段最长，三者重叠区域，也就是S1所在区域，是在标记RM190与RM204间大约1.4 Mb区域（图3）。同时利用IRAT216S1-G3来源的1567、1569群体226株SDS微量抽提的DNA进行了重组体分析，也把S1初步定位在此区域（图4）。再利用1559、1561群体1 940株SDS微量抽提的DNA，利用表1中部分标记与表2中后来开发的标记进行重组体筛选分析（表3），把S1的定位区域再次缩小到标记RM3463与RM19359之间大约95 kb的距离，所在克隆为PAC克隆P0535G04，列举了1559、1561群体中部分植株（大部分的重组子）在各标记之间的基因型（表3）。