《表1 栀子转录组组装拼接情况统计》

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《栀子环烯醚萜类物质生物合成相关基因的挖掘与分析》

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通过对栀子的果实进行转录组测序，共获得了55 327 054个Raw reads，对获得的Raw reads进行数据过滤后得到54 269 850个Clean reads，Q20、Q30分别为97.97%和94.09%，GC%含量为44.16%。从测序产出数据质量评估结果可见，本次测序数据饱和度较高，为后续转录本的拼接提供了良好的数据支撑。本研究采用软件Trinity（Grabherr et al.，2011）对Clean reads进行拼接组装，共获得95 676个转录本（Transcripts），平均长度1 180 bp，‘N50’为2 624 bp。并对得到的Transcripts序列进一步组装获得75 539条Unigenes，平均长度1 614 bp，‘N50’为2 695 bp。长度在200 bp～500 bp的Unigene序列有10 222条，占总体的13.53%；有13 359条Unigenen的长度聚集在500 bp～1 000 bp，占总Unigene数的17.68%；有22 111条Unigenen的长度聚集在1 000 bp～2 000 bp，占总Unigene数的29.27%；有29 847条Unigenen的长度超过2 000 bp，占总Unigene数的39.51%（表1）。