《表1 青狗尾草SBP基因家族特性》

《表1 青狗尾草SBP基因家族特性》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《青狗尾草(Setaria viridis)SBP基因家族的鉴定及表达分析》


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从青狗尾草全基因组中预测得到17个SBP基因,分别命名为SvSBP1~SvSBP17(表1),这些基因中,SvSBP8和SvSBP13分别有10个外显子,SvSBP10和SvSBP17拥有11个,而这4个基因编码的氨基酸序列明显比其他基因编码的长,其中Sv SBP13蛋白的氨基酸残基数目达到1 118。其余基因的外显子较少,SvSBP2有4个,SvSBP1、Sv SBP3、SvSBP4、SvSBP7、SvSBP9、SvSBP11、SvSBP12、SvSBP14~SvSBP17有3个外显子(图1),这些基因所编码蛋白的氨基酸残基数目处于300~450之间,SvSBP5和SvSBP6只有2个外显子(图1),编码蛋白质氨基酸残基数分别为199和213。另外,共有5个基因编码的蛋白质等电点处于7以下,其中4个就是编码最长蛋白的基因。以17个SBP蛋白氨基酸序列为基础构建系统发育树,结果表明那些结构相类似的基因编码的蛋白也聚类在一起。