《表1 不同乳腺癌亚型的样本数》
本文从TCGA数据库网站(https://tcga-data.nci.nih.gov/tcga)下载了乳腺癌(BReast invasive CArcinoma,BRCA)患者异构体表达数据,使用每百万转录本(Transcripts Per Million,TPM)来衡量样本的表达丰度。其中共有20531个基因,73599个异构体。为了避免低表达量异构体的干扰,且考虑到发生可变剪接的基因至少含两个异构体,本文筛选在50%以上样本中表达量至少为0.1 TPM的异构体,再剔除掉只含单个异构体的基因,最终保留33481个异构体,对应的基因个数为10178个。从UCSC xena网站(https://xenabrowser.net/datapages/)下载相应样本的临床数据,对于各种乳腺癌亚型样本数如表1所示。
图表编号 | XD00151367200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.01 |
作者 | 许鹏、王兵、方刚、石晓龙、刘文斌 |
绘制单位 | 广州大学计算科技研究院、黔南民族师范学院计算机与信息学院、温州大学计算机与人工智能学院、广州大学计算科技研究院、广州大学计算科技研究院、广州大学计算科技研究院、温州大学计算机与人工智能学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |