《表4 转录组数据信息对照表》

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《椰子ZF-HD基因家族的鉴定及生物信息学分析》

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在NCBI数据库中下载不同品种椰子叶片与椰子胚、胚乳及胚愈伤组织的转录组数据（表4）。用FPKM(Fragments Per Kilobase Million）的计算方法标准化paired-end测序的转录组数据。在检索椰子ZF-HD基因家族基因号后，得到椰子ZF-HD基因家族在叶片、胚乳、胚以及胚愈伤组织中的FPKM值，并以l g函数处理FPKM值，将处理后的数据导入MeV软件构建基因表达谱（图6）。除CoZHD18外，所有椰子ZF-HD基因家族成员在胚愈伤组织中均有表达，这说明大部分椰子ZF-HD基因在椰子的早期生长与分化中起着至关重要的作用。CoZHD18、CoZHD20整体表达量较少，其具体功能还尚待研究。CoZHD 12、CoZHD 13、CoZHD 14在叶片中表达较少，其主要在在胚、胚乳、胚愈伤组织中表达，说明其与幼苗的发育有关。CoZHD13在胚乳中有较高的表达，在胚中几乎没有表达、在胚愈伤组织中却有所表达，其可能与椰子胚乳的形成有关。CoZHD9、CoZHD15、CoZHD19在各部位中均有较高的表达量，其可能在整个椰子的生长周期中发挥作用。已有研究证明，拟南芥在受到盐胁迫时会诱导ZHD盐亚族基因的表达[10]，而与其同亚族的椰子CoZHD9在椰子叶片、胚、胚乳、胚愈伤组织中均有较高的表达，这可能与椰子本身较高的耐盐性有关。CoZHD16在叶片中表达量较低，但在胚乳、胚、胚愈伤组织中均有较高的表达量，它可能主要参与椰子果实生长发育的调控。