《表2 药物与靶标蛋白对接结果》

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《基于网络药理学及分子对接研究六味醒神颗粒治疗肝性脑病的分子作用机制》

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将AKT1、TP53、IL6、TNF、JUN、PPARG等6个基因输入PDB数据库（http://www.rcsb.org/）下载蛋白结构。根据TCMID、TCMSP数据库及查阅相关文献发现，胆南星、石菖蒲主要有效化合物为榄香素、甲基丁香油酚、齐墩果酸、黄樟素、β-细辛醚、α-细辛醚[13-14]。将君药及3种阳性对照药有效化合物输入ZINC数据库（http://zinc.docking.org/），下载分子结构。因TP53蛋白的PDB结构没有原配体，将不作深入分析。通过iGEMDOCK软件计算发现，君药中大部分有效成分的匹配能量分数与阳性对照药物L-鸟氨酸L-门冬氨酸、纳洛酮及氟马西平相近，部分成分甚至优于阳性对照药。（见表2、图2）用LigPlot软件展示胆南星、石菖蒲中主要有效成分与IL-6结合最好的构象二维图。（见图3）