《表1 GO功能富集分析》

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《Bx–daf–2与Bx–tre–1协同调控海藻糖促进松材线虫低温抗逆》

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应用FPKM进行表达量均一化，得到非重复序列基因表达量，使用PossionDis检测DEG，检测到上调表达基因1 419条（图1和图2–A1的红色数据点），下调表达基因762条（图1和图2–A1的蓝色数据点），其余基因表达量未发生显著变化（图1和图2–A1的灰色数据点）。对检测到的2 181条DEG进行GO富集分析，富集到GO:0032501（多细胞生物过程184条基因）和GO:0032502（发育过程，181条基因）功能的基因显著上调表达（表1）。进一步分析，发现多数DEG具有GO:0004672（蛋白激酶活性）、GO:0005488（结合）、GO:0033036（大分子定位）和GO:0040024（抗逆态幼虫发育）功能，对这类DEG进行Kegg Orthology分析，筛选出Bx–daf–2（表达量比对数值为–2.66，FDR值为4.50E–10），处于各类DEG路径的调控位置。