《表2 达氏鲟MAP1LC3B氨基酸序列与各参考物种MAP1LC3B氨基酸序列的同源性》
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《达氏鲟自噬基因MAP1LC3B克隆及其组织表达分析》
利用ClustalW对达氏鲟MAP1LC3B氨基酸序列与GenBank已公布参考物种MAP1LC3B氨基酸序列进行同源性比对分析,得知达氏鲟与各参考物种的MAP1LC3B氨基酸序列同源性分别为:斑马鱼(D.rerio)96.7%,非洲爪蛙(Xenopus tropicalis)95.2%,人类(Homo sapiens)94.4%,草鱼(Ctenopharyngodon idella)93.6%,鲤鱼(Cyprinus carpio)92.8%,褐家鼠(Rattus norvegicus)92.0%,虹鳟(Oncorhynchus mykiss)91.2%,青鳉(Oryzias latipes)91.2%(表2)。MAP1LC3B氨基酸序列的多重比对分析结果表明,达氏鲟MAP1LC3B氨基酸序列中含有一个GAB-ARAP泛素结构域和C端甘氨酸残基,同时具有维管束蛋白结合位点、Atg4识别位点、Atg7结合位点及脂化位点(图5)。基于MAP1LC3B氨基酸序列同源性,采用MEGA 5.2构建系统发育进化树(图6),发现哺乳类动物聚为一支,而达氏鲟与其他鱼类聚为另一支,表明其与鱼类的亲缘关系较近。
图表编号 | XD00132360700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.01 |
作者 | 胡伟、许巧情、郭慧芝、李由申、韩盼盼、袁汉文、张书环、陈敦学 |
绘制单位 | 中国水产科学研究院长江水产研究所、农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室、长江大学动物科学学院、长江大学动物科学学院、长江大学动物科学学院、长江大学动物科学学院、长江大学动物科学学院、长江大学动物科学学院、中国水产科学研究院长江水产研究所、农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室、贵州大学动物科学学院 |
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