《表2 凡纳滨对虾转录组微卫星分析结果》
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《凡纳滨对虾微卫星分子标记的开发及不同养殖家系遗传多态性分析》
凡纳滨对虾转录组SMRT测序共获得51367条非冗余全长转录本序列(GenBank登录号SRX3267788~SRX3267801),利用MISA对这些转录本序列进行分析,共获得39674条微卫星序列,分布在29461条转录本序列中,包含微卫星的序列占总序列的57.35%。序列拼接总长度为171322994 bp,微卫星的分布密度为0.232 SSR/kb,平均每4.32 kb出现1条微卫星序列。各核苷酸重复类型的凡纳滨对虾微卫星数量差异明显,其分布密度也存在明显差异。在所鉴定的39674条凡纳滨对虾微卫星序列(表2)中,二核苷酸重复微卫星序列分布最多,共有22223条(占56.01%);三核苷酸重复微卫星序列14781条(占37.26%),四核苷酸重复微卫星序列1947条(占4.91%),六核苷酸重复微卫星序列441条(占1.11%);分布最少的是五核苷酸重复微卫星序列,仅有282条(占0.71%)。
图表编号 | XD00132358600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.01 |
作者 | 李强勇、李旻、曾地刚、朱威霖、彭敏、杨春玲、刘青云、赵永贞、陈秀荔、陈晓汉 |
绘制单位 | 广西水产科学研究院、广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室、广西水产科学研究院、广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室、广西水产科学研究院、广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室、广西水产科学研究院、广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室、广西水产科学研究院、广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室、广西水产科学研究院、广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室、广西水产科学研究院、广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室、广西水产科学研究院、广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室、广西水产科学研究院、广西水产遗传育种与健康养殖 |
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