《表1 水红宝巾花转录组中的SSR基序类型》
宝巾花转录组的SSR类型丰富,包括单核苷酸至六核苷酸的所有重复类型,共包含117种重复基序,其中数量最多的3种基序为A/T、AT/AT和C/G,分别为43 222个(71.67%)、4 009个(6.65%)和1 727个(2.83%)(表1)。SSR基序的重复次数为5~25次,重复10次的SSR位点最多(10 265个,17.03%),而25次的最少(1个)(图1)。重复序列总长为10~302个碱基、平均18.1个碱基,绝大多数的重复序列总长为10~21个碱基,共(51 981个,占总数55 976个(因有2种或多种SSR基序相连,少于SSR的总数)的92.86%。
图表编号 | XD00131416800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.28 |
作者 | 孙利娜、林茂、陈升侃、孙开道、陈尔、李进华、唐庆、甘四明 |
绘制单位 | 中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业局重点实验室、广西壮族自治区林业科学研究院广西优良用材林资源培育重点实验室中南速生材繁育国家林业局重点实验室、广西壮族自治区林业科学研究院广西优良用材林资源培育重点实验室中南速生材繁育国家林业局重点实验室、广西壮族自治区林业科学研究院广西优良用材林资源培育重点实验室中南速生材繁育国家林业局重点实验室、广西壮族自治区林业科学研究院广西优良用材林资源培育重点实验室中南速生材繁育国家林业局重点实验室、广西壮族自治区林业科学研究院广西优良用材林资源培育重点实验室 |
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