《表2 候选基因的结构域功能分析》

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《利用TRV-HIGS技术鉴定核盘菌致病相关的分泌蛋白基因》

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图1为8个候选基因在侵染感病、抗病甘蓝叶片上的表达热图。为了进一步了解这8个候选基因的功能，分析了其蛋白质结构域。SMART分析显示，这8个具有信号肽结构的候选基因具有不同类型的SCOP功能域，其中有4个候选基因（SS1G＿04945、SS1G＿03181、SS1G＿11912和SS1G＿07655）具有不同类型的PDB功能域，此外有4个基因具有不同类型Pfam功能域，其中SS1G＿04945具有Glyco＿hydro＿7结构域，SS1G＿03181具有ASP结构域，SS1G＿11912具有NPP1结构域，SS1G＿07655具有Pro-kuma＿activ结构域。SS1G＿02250则包含重复结构域（表2）。将SMART分析得到的候选基因的结构域分别在Pfam、PDB以及SCOP数据库中进行了功能注释，随后对这8个候选可能参与的功能进行了预测。SS1G＿00263可能参与核盘菌对药物耐受性的调节，SS1G＿04945可能参与多糖的水解，SS1G＿03181可能参与蛋白的水解，SS1G＿04343可能参与诱导植物的病原相关分子模式（pathogen-associated molecular pattern，PAMP）引发的免疫反应（PAMP-triggered immunity，PTI）或物质的异构化过程，SS1G＿03146可能参与生物素合成，SS1G＿02250可能参与核酸分子磷酸基团的水解，SS1G＿11912可能参与坏死诱导蛋白或毒素的产生从而诱导植物的效应蛋白所引发的免疫反应（effector-triggered immunity，ETI)，SS1G＿07655可能参与肽链或蛋白质的水解过程（表2）。