《表1 3套鼻咽癌基因芯片基本信息》

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《多个GEO芯片联合分析筛选鼻咽癌易感基因》


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基因表达谱芯片筛选及数据处理利用美国国立生物技术信息中心(NCBI)平台下的基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)检索含有人源鼻咽癌样本的芯片,选取基因芯片GSE12452、GSE13597、GSE64634,见表1。利用R语言软件包Affy(version 1.50.0,http://bioconductor.org/help/search/index.html?q=affy/)对数据进行表达值背景矫正和表达谱数据的归一化预处理,包括原始数据格式的转换,缺失值补充,背景矫正,以及用分位数法进行数据标准化。