《表1 参比毒株:山羊地方性鼻内肿瘤病毒ENTV-2FJ株的分离纯化和全基因组序列分析》
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《山羊地方性鼻内肿瘤病毒ENTV-2FJ株的分离纯化和全基因组序列分析》
ENTV-2:山羊地方性鼻内肿瘤病毒;JSRV:绵羊肺腺瘤病毒;enJSRV:内源性绵羊肺腺瘤病毒;ENTV-1:绵羊鼻内肿瘤病毒;enENTV:羊内源性地方性鼻内肿瘤病毒;/:毒株的采集年份没有公开;下同
用DNAStar 7.1中的SeqMan7.1软件对7个片段的序列进行拼接,命名为ENTV-2FJ株。用MegAlign对ENTV-2FJ株与ENTV-2、绵羊肺腺瘤病毒(Jaagsiekte sheep retrovirus,JSRV)、内源性绵羊肺腺瘤病毒(Endogenous jaagsiekte sheep retrovirus,en JSRV)、绵羊鼻内肿瘤病毒(Ovine enzootic nasal tumor virus,ENTV-1)、内源性逆转录病毒(Endogenous enzootic nasal tumor virus,enENTV)等相关毒株病毒的全基因组、群相关抗原(group associated antigen,gag)和囊膜蛋白(envelope protein,env)基因进行相似性分析,用MEGA7.0邻接法构建系统进化树,参比毒株见表1,用NCBI上的ORFfinder在线软件进行开放阅读框分析。
图表编号 | XD00121579600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.25 |
作者 | 江锦秀、林裕胜、张靖鹏、游伟、黄丽丽、毛坤明、胡奇林 |
绘制单位 | 福建省农业科学院畜牧兽医研究所、福建省农业科学院畜牧兽医研究所、福建省农业科学院畜牧兽医研究所、福建省农业科学院畜牧兽医研究所、福建师范大学、福清市畜牧兽医技术服务中心、福建省农业科学院畜牧兽医研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |