《表2 SSR搜索结果统计》

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《锥栗基因组SSR开发及农家品种的遗传多样性分析》


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通过计算read的R1端和R2端整合后各序列的长度,做出长度分布图(图2),序列长度主要集中在200~250与350~400 bp之间。通过过滤得到高质量Reads数量4 729 726,占下机Reads的91.93%。通过序列合并,得到2 364 881,可以合并的Read pair数2 051 475对,占整数的86.75%。在2 051 475条序列中,总共搜索到2 117 345个SSR。在所有具有SSR的序列中565 603条序列包含1个以上SSR,以复合形式存在的SSR数量为640 155个(表2)。