《表1 杂交鳢的unigenes长度分布》
经De novo拼接后,共获得65 396条transcripts,碱基序列为57 147 076 bp,其中N50(将转录本从长到短排序,依次累加碱基数,当累计碱基数达转录本总碱基数的50%时的转录本的长度)的片段长度达1 524 bp,平均长度为873 bp;在transcripts数据基础上,经Trinity对序列再次进行组装,最终获得52 065条unigenes,碱基序列为36 980 316 bp,序列长度为201~12 407 bp,平均长度为710 bp,其中N50为1 090 bp。对每条unigenes序列的长度进行相应数量统计,发现unigenes序列的长度都主要分布在200~500 bp,随着序列长度的增加,unigene数量逐渐减少(表1),但长度≥2 000 bp的仍有3 459条,也说明本次测序的数据组装质量较高。
图表编号 | XD00101770700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.25 |
作者 | 黄勇、龚望宝、陈海刚、孙西红 |
绘制单位 | 河南科技大学动物科技学院、中国水产科学研究院珠江水产研究所、中国水产科学研究院南海水产研究所、广东省渔业生态环境重点实验室、河南科技大学动物科技学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |