《表1 BSA与唑啉草酯对接结果》

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《唑啉草酯及其代谢物与转运蛋白的作用模式研究》


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为确定唑啉草酯和M2在BSA内的结合位点,我们利用Sybyl软件高通量模式共生成了11个BSA活性口袋.将Gaussian优化后的唑啉草酯对接在11个活性口袋中,对接结果列于表1.结果显示,有7个对接模型结果的总打分值在4以上,编号分别为1,2,5,8,9,10和11.观察结合位点0.3nm范围内残基,其中1,5,8和11号对接模型在结合位点附近含有荧光氨基酸Trp或Tyr,而打分值最高的2号对接模型附近未出现荧光性氨基酸.